Kopplingarna mellan säkerhetssektorreform (SSR) och resolution 1325 är många. SSR syftar till att stärka säkerhetsinstitutioners effektivitet och främja demokrati, öppenhet och ansvarsutkrävande. Resolutionen lyfter fram kvinnor som viktiga aktörer för hållbar fred och säkerhet. En nations säkerhet kräver att både kvinnors och mäns kompetens används för att skapa, definiera och upprätthålla denna säkerhet. Operation 1325 arbetar för att belysa vikten av att öka kvinnors deltagande och stärka skyddet för kvinnor inom ramen för säkerhetssektorreform.
SSR baserar sig på ett vidgat säkerhetsbegrepp som förutom militär säkerhet även omfattar politisk och ekonomisk trygghet samt fördjupar begreppet nationell säkerhet till att omfatta trygghet för individen, d.v.s. mänsklig säkerhet. En fungerande rättsstat tillsammans med en fungerande säkerhetssektor är viktiga byggstenar för att skapa hållbara demokratier och minska risken för att väpnad konflikt bryter ut. En grundförutsättning för att ge hållbara effekter är säkerhetsanalyser som baseras på behov och problem för en bredare grupper, bl.a. inkluderandet av kvinnors säkerhetsbedömning.
Under hösten 2011 till våren 2012 har Operation 1325 i nära samarbete med kvinnoorganisationer från irakiska Kurdistan och Sudan med projektet "Security and Justice".